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Structure, assembly, and mechanism of the MmpL family of transporters
系统梳理 MmpL 家族转运蛋白（MmpL3/4/5）的结构、组装与转运机制：MmpL3 是抗结核成药靶点，MmpL5–MmpS5 通过药物外排介导贝达喹啉/德拉马尼耐药。
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文献资料库
我关注的细菌耐药与蛋白工程方向精选文献与精读笔记
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Machine learning-guided evolution of pyrrolysyl-tRNA synthetase for improved incorporation efficiency of diverse noncanonical amino acids
用「小数据有监督模型（FFT-PLSR）+ 零样本深度模型（ESM-1v / MutCompute / ProRefiner）」挖掘 PylRS 的 tRNA 结合域，得到 Com2-IFRS：非天然氨基酸掺入效率较起点提升 30.8 倍，且突变可移植到 7 种衍生酶、覆盖 6 类非天然氨基酸。
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Structures of MmpL complexes reveal the assembly and mechanism of this family of transporters
同组在 MMBR 综述之前的原始研究：从粗膜样本中一次性解析出 AcpM–MmpL5 二维阵列、AcpM–MmpL5–MmpS5 三聚体（3:3:3）与 AcpM–MmpL5 三聚体三套结构，回答了 MmpL5 的寡聚状态问题，并揭示"针状"跨膜转运机制。
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Combinatorial assembly and optimisation of designer cellulosomes: a galactomannan case study
把 VersaTile 从裂解酶扩展到"设计型纤维小体"：建立 dockerin/cohesin/linker/tag/酶模块的瓷砖库，快速组装并优化可降解半乳甘露聚糖的三价多酶复合物。
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Rapid and High-Throughput Evaluation of Diverse Configurations of Engineered Lysins Using the VersaTile Technique
用 VersaTile 快速构建 5 个不同构型的组合裂解酶库靶向肺炎克雷伯菌，评估 940 个变体活性并对 74 个 top hit 测序，归纳出"OMP+EAD 是关键、特定构型更优"的工程化设计规则。
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A VersaTile-driven platform for rapid hit-to-lead development of engineered lysins
VersaTile 平台的奠基性论文：模块化"瓷砖"组装构建约 10,000 个工程化裂解酶变体，迭代筛选出在人血清与离体猪烧伤模型中抗鲍曼不动杆菌的高活性先导分子。
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